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quarta-feira, 30 de maio de 2012

GenBank

GenBank

O GenBank, criado no centro norteamericano para informação biotecnológica (NCBI, na sigla em inglês), foi um dos primeiros e ainda é o mais popular banco de dados para o depósito de seqüências de DNA.
É lá que pesquisadores de todo o mundo depositam as seqüências de As, Cs, Gs e Ts (iniciais das ‘peças’ básicas da molécula de DNA, os nucleotídeos adenina, citosina, guanina e timina) que obtêm ao seqüenciar o genoma dos mais diversos organismos. No final dos anos 90 observouse um crescimento exponencial do número de seqüências de biomoléculas depositadas no GenBank
Esse aumento teve início a partir de 1990, quando surgiram os sequenciadores de DNA a laser, totalmente
automatizados. Tais máquinas têm com freqüência 96 capilares (tubos minúsculos por onde passam os fragmentos de DNA) e podem ‘ler’, em média, 550 letras (A, C, G e T) por capilar em cada análise. Há cerca de 3 bilhões dessas letras no genoma humano. Seqüenciadores ainda mais potentes, com 384 capilares, podem ‘ler’ mais de um milhão de letras do DNA por dia. A grande maioria das seqüências publicadas em bancos de dados internacionais vem de projetos genoma
e transcriptoma (ou de genoma funcional).

Hoje, o GenBank  já contém 1.628 genomas de vírus, 174 genomas de procariotos (bactérias e arqueobactérias) e 20 genomas de organismos eucarióticos. Essa imensa quantidade de informação vem se tornando cada vez mais complexa com o estudo das interações entre biomoléculas e das variações
existentes entre os indivíduos de uma população


Referencia site GenBank:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/

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